Основной целью АО «ГНЦ НИИАР» в области охраны окружающей среды является обеспечение экологической и радиационной безопасности деятельности.
НИИАР ежегодно выпускает публичные отчеты по экологической безопасности, которые предназначены для информирования заинтересованных сторон, партнеров и общественности, граждан и местного самоуправления. Основным корпоративным документом, регламентирующим деятельность АО «ГНЦ НИИАР» в области охраны окружающей среды и обеспечения экологической безопасности, является Политика АО «ГНЦ НИИАР» в области экологии , определяющая принципы деятельности Института в экологической сфере.
